經營管理與會計研究所
該研究所收集與管理、會計和貿易相關的研究論文與材料。該研究所出版拓殖大學「管理會計研究」刊物，並舉辦研究學會、講座、討論會以及公益活動。舉辦地區慈善活動，如與文京學院合作舉辦電腦講座，並通過徵收與獎勵學術研究論文來提升學生的學術研究水平。

政治經濟研究所
該研究所收集與政治、法律和經濟相關的研究論文與材料。出版拓殖大學「政治、經濟與法律研究匯總」刊物，並舉辦研究學會、講座、討論會以及公益活動。同時徵收學術論文以提供助學金，與文京學院聯合舉辦公益活動並推介研究成果。

語言文化研究所
該研究所收集與語言文化相關的研究論文與材料，出版拓殖大學「語言研究」刊物並舉辦研究學會、講座以及討論會。通過舉辦公共講座，課程包括日語教學及以亞洲語言為主的 15 種語言的外語學習，向公眾敞開其大門。

理工學綜合研究所
該研究所收集與科學和工程相關的研究論文與材料。還舉辦研究學會、講座以及討論會。研究成果發表在拓殖大學「科技研究報告」公報中，並在與文京學院合作舉辦的公共講座中引介。該研究所贏得了公眾的高度尊重，研究與學術活動經常得到企業的資助。

人文科學研究所 
該研究所收集與人文學有關的研究報告與材料，並出版拓殖大學「人文、自然與人類學研究匯總」公報。還舉辦研究學會、講座以及討論會。因為涵蓋了專業研究生科目之外的其他院系的學術領域，所以該研究所彙集了來自所有院系的研究人員，形成了一個由各種專業研究人員組成的學術團體。

國際事務研究所 
基於我們大學的創辦精神，該研究所積極收集並出版研究報告、文獻與資料，並舉辦研究學會、培訓班、討論會以及公共講座。每月還在「世界事務」期刊上公佈結果。許多講座包括在公共國際關係課程中，涉及國際和國內關係以及國際問題，受到學員的好評。

日本文化研究所 
基於我們大學的創辦精神，我們顧及日本文化的各個方面並進行研究與出版，以使日本人民及世界人民能夠正確地瞭解日本的文化與歷史。每季度在「新日本研究」刊物上發表日本文化與相關領域的研究調查結果，並在研究學會、講座、討論會以及公開活動中進行介紹。

國際發展研究所 
該研究所旨在從國際視角調查與研究國際合作以及亞太地區的各個方面（包括歷史、文化、語言、政治、社會以及經濟），並為學術進步與地區發展作貢獻。為達到這一目標，出版了「國際發展研究」公報，舉辦了研究學會、講座以及討論會並收集了相關的文檔。

日語教育研究所 
該研究所調查與研究日語教育並公佈結果，為促進國際間的理解作貢獻。還出版公報，舉辦材料開發與研究學會、討論會以及公共講座並接收附屬學校派遣的教師。 

伊斯蘭研究所
該研究所系統地查究伊斯蘭教世界的各個方面並對其根源、伊斯蘭教律法進行研究調查，旨在促進日本的各種交流和相互間的理解。通過出版「伊斯蘭教律法研究」與「時事通訊」公報，舉辦「古蘭經研究」公共研究學會，為社會作貢獻。

區域行政研究所 （2009 年 4 月設立）
該研究所開展區域行政管理及相關領域的研究調查。附屬區域行政管理中心通過區域政治與行政以及 NPO（非營利組織）活動促創對區域社群未來肩負責任的領導人網路。